分子構造発生ソフトメモ

ネットで見つけたのは原子の組み合わせから網羅的に提案するソフト、MOLGENとOMG。
しかし、これだと合成できないものも含め、大量に発生してしまう。
文献由来だと新規構造が出にくそう。
現実的なのは部分骨格の組み合わせで構造発生させることかも。これはchemofficeなどを使えばできるはず。
そして部分構造をMOLGENとOMGで発生させ、合成できるかどうかを調べて、新たな部分骨格を探す。

MOLGEN
http://www.molgen.de/

サイトは更新されているようだがソフト開発は2009年から止まっている模様。最新版はMOLGEN 5

PDFマニュアル

online版
http://www.molgen.de/online.html

Gugisch, R., Kerber, A., Kohnert, A., Laue, R., Meringer, M., Rücker, C., Wassermann, A.: MOLGEN 5.0, A Molecular Structure Generator (2016) Advances in Mathematical Chemistry and Applications: Revised Edition, 1, pp. 113-138.

OMG: Open Molecule Generator
Journal of Cheminformatics20124:21
https://jcheminf.springeropen.com/articles/10.1186/1758-2946-4-21

開発は止まっている模様。使用は続いているみたい。
https://sourceforge.net/projects/openmg/